HRM法SNP分型服務(wù)
來(lái)源:本站 作者:jiyuanbio 時(shí)間:2025/5/23
HRM 技術(shù)助力 SNP 分型技術(shù)服務(wù)
在基因檢測(cè)領(lǐng)域,單核苷酸多態(tài)性(SNP)分型作為探索遺傳變異的關(guān)鍵技術(shù),廣泛應(yīng)用于疾病關(guān)聯(lián)研究、藥物基因組學(xué)和群體遺傳學(xué)等多個(gè)方面。高分辨率熔解曲線分析(High Resolution Melting,HRM)技術(shù)憑借其快速、準(zhǔn)確、無(wú)需標(biāo)記等特點(diǎn),成為 SNP 分型的有力工具。我司可以為您提供HRM分型的服務(wù)。
一、HRM 的原理
HRM 技術(shù)的核心原理基于 DNA 雙鏈在加熱過(guò)程中解鏈的特性。當(dāng) DNA 雙鏈?zhǔn)軣釙r(shí),堿基對(duì)之間的氫鍵逐漸斷裂,雙鏈解開(kāi)成為單鏈,這個(gè)過(guò)程稱為熔解。而 DNA 的熔解溫度(Tm 值)主要由其堿基組成、長(zhǎng)度和 GC 含量決定,不同的 DNA 序列,即使只有一個(gè)堿基的差異(即 SNP 位點(diǎn)),其 Tm 值也會(huì)有所不同。
在 HRM 分析中,首先對(duì)含有目標(biāo) SNP 位點(diǎn)的 DNA 片段進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增。隨后,在緩慢升溫過(guò)程中,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào)。隨著溫度升高,DNA 雙鏈逐漸解鏈,原本結(jié)合在雙鏈 DNA 上的飽和熒光染料(如 LC Green、SYTO 9 等)會(huì)從 DNA 上脫離,導(dǎo)致熒光信號(hào)下降。通過(guò)儀器精確記錄熒光強(qiáng)度隨溫度變化的曲線,即熔解曲線。由于 SNP 位點(diǎn)的存在會(huì)改變 DNA 片段的穩(wěn)定性,使得含有不同等位基因的 DNA 片段熔解溫度出現(xiàn)差異,從而在熔解曲線上呈現(xiàn)出不同的峰形。科研人員可以通過(guò)分析這些熔解曲線的差異,快速準(zhǔn)確地判斷樣本的 SNP 基因型 。
二、送樣要求
為確保 HRM 技術(shù)能夠準(zhǔn)確有效地進(jìn)行 SNP 分型,規(guī)范的送樣至關(guān)重要。以下是詳細(xì)的送樣要求:
(一)樣本類型
- DNA或cDNA:要求 DNA 純度高,無(wú) RNA、蛋白質(zhì)、酚類、鹽類等雜質(zhì)污染。A260/A280 比值應(yīng)在 1.8 - 2.0 之間,A260/A230 比值應(yīng)大于 2.0。
- 引物:請(qǐng)?zhí)峁┥舷掠我?,最好是摸索過(guò)退火溫度的。如果沒(méi)法提供引物。也可以幫忙設(shè)計(jì)引物,但要提供模板的序列。
(二)樣本質(zhì)量
- DNA 濃度:建議提供的 DNA 樣本濃度在 50 - 200 ng/μL 之間,每個(gè)樣本體積不少于 20 μL,即每個(gè)樣本 DNA 總量不少于 1 μg。對(duì)于濃度較低的樣本,需提前說(shuō)明并提供足夠的體積。
- DNA 完整性:基因組 DNA 應(yīng)保持較好的完整性,電泳檢測(cè)時(shí)主帶清晰,無(wú)明顯降解。若 DNA 降解嚴(yán)重,可能影響 PCR 擴(kuò)增和 HRM 分析結(jié)果。
(三)樣本標(biāo)識(shí)與信息
- 每個(gè)樣本必須有唯一且清晰的標(biāo)識(shí),可采用編號(hào)、條形碼等方式。標(biāo)識(shí)應(yīng)與送樣單上的信息完全一致,避免混淆。
- 送樣時(shí)需同時(shí)提供詳細(xì)的樣本信息表,包括樣本編號(hào)、樣本類型、采集時(shí)間、保存條件、研究目的、目標(biāo) SNP 位點(diǎn)信息(如已知的 SNP 位點(diǎn)名稱、染色體位置等)以及客戶聯(lián)系方式等。準(zhǔn)確完整的信息有助于實(shí)驗(yàn)人員更好地開(kāi)展檢測(cè)工作。
(四)運(yùn)輸與保存
- DNA 樣本:應(yīng)將 DNA 樣本分裝到無(wú)菌、無(wú)酶的離心管中,密封后放入冰盒或干冰中運(yùn)輸。若短期保存(1 - 2 周),可將樣本置于 -20℃冰箱;長(zhǎng)期保存需置于 -80℃冰箱。
三、HRM 技術(shù)的應(yīng)用優(yōu)勢(shì)與案例
HRM 技術(shù)不僅操作簡(jiǎn)便、成本較低,還能在短時(shí)間內(nèi)對(duì)大量樣本進(jìn)行高通量分析。在實(shí)際應(yīng)用中,例如在乳腺癌易感基因 BRCA1 和 BRCA2 的 SNP 分型研究中,HRM 技術(shù)能夠快速準(zhǔn)確地檢測(cè)出與乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的 SNP 位點(diǎn),為乳腺癌的早期篩查和個(gè)性化治療提供重要依據(jù)。此外,在藥物基因組學(xué)領(lǐng)域,通過(guò) HRM 技術(shù)對(duì)藥物代謝酶基因的 SNP 分型,可以預(yù)測(cè)患者對(duì)特定藥物的代謝能力和不良反應(yīng),實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)用藥 。
HRM 技術(shù)以其獨(dú)特的原理和顯著的優(yōu)勢(shì),為 SNP 分型提供了高效、可靠的解決方案。嚴(yán)格遵循送樣要求,是獲得準(zhǔn)確檢測(cè)結(jié)果的基礎(chǔ)。無(wú)論是科研探索還是臨床應(yīng)用,HRM 技術(shù)都展現(xiàn)出巨大的潛力,有望在未來(lái)的基因檢測(cè)領(lǐng)域發(fā)揮更加重要的作用。如果您對(duì) HRM 技術(shù)或送樣要求還有其他疑問(wèn),歡迎隨時(shí)與我們聯(lián)系,我們將竭誠(chéng)為您解答。
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